Trabajo de campo
Preparándose para el trabajo de campo
Etiquete las bolsas de recolección con el ID de muestra y la fecha antes de ir al campo, esto le ahorrará tiempo y evitará posibles errores.
La información requerida en las etiquetas incluye: sitio, parcela, subparcela, punto de tiempo y cualquier otra descripción específica del área.
Example: CNF,1,N,T1 (CNF1NT1) 1.31.2022
Lleve bolsas de recolección adicionales (limpias y selladas dentro de una bolsa grande con cierre hermético), en caso de que sean necesarias
Guantes (lleva suficientes guantes limpios en una bolsa ziplock para el día)
Aerosol de etanol y toallitas de etanol
Aerosol de etanol, fácil de llevar y útil si te quedas sin toallitas
Las toallitas de etanol se pueden hacer en el laboratorio el día antes de salir. Corte las toallas de papel por la mitad, colóquelas en bolsas grandes con cierre hermético, agregue etanol hasta que las toallas estén saturadas con etanol y vea que se acumula algo de etanol en el fondo de la bolsa y selle la bolsa. ¡Las toallitas están listas!
Descorazonador de suelo o herramientas de muestreo (siempre lleve uno o dos adicionales, en caso de que uno de ellos se rompa en el medio del campo)
Cinta de señalización y estacas flags
cinta métrica
Bolsas de campo para transportar equipos y muestras hacia y desde los sitios
Sharpies y bolígrafos (si tiene una cinta brillante para marcar, es una buena idea marcar sus bolígrafos, puede localizarlos fácilmente si se caen)
Cuaderno de campo
GPS y baterías extra
Parcela cuadrada (para medir)
Regla o vara de medir (si se mide materia orgánica, basura, etc.)
Pala: requerida para emergencias como quedarse atascado en el barro
Herramientas de seguridad
1. Pala (por si te atascas)
2. Protectores de serpientes
3. Aerosol para osos
4. GPS, baterías y cargadores de teléfonos
5. Mapas de georreferenciación (trabajan sin conexión y te permiten marcar y tomar notas directamente sobre ellos)
Selección del sitio
Mapas, SIG para posibles selecciones de mapas
Exploración
Configuración de las parcelas
_cc781905-5cde-3194-bb3b5cf58d_ _cc781905-5cde-3194-bb3b5cf58d_
Temporal sampling (multiple sampling events over time)
Recopilación de datos
Evitar la contaminación de las muestras.
1. Always wear gloves when collecting and sterilize _cc781905-5cde-3194- bb3b-136bad5cf58d_ tanto los guantes como la herramienta de muestreo de suelo después de cada recolección (por parcela o subparcela), etc._cc781905-5cde-31936d_bad5-cf55
Data Collection
Additional information on methods can be found in published articles (here)
In the field
Prevent contamination of samples:
1. Always wear gloves when collecting samples and ethanol/bleach
sterilize both the gloves and soil sampling tool after each
collection (per plot or subplot), etc.
2. Ensure that soil samples are collected in the same manner,
from all plots (treated and untreated).
3. Once collected, ensure soil samples are placed in a cooler
with ice packs or dry ice to transport to the lab.
In the Lab
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Always keep samples cool/frozen: If you are not processing the soil samples on the same day, make sure to put them in the fridge. If you have a walk-in fridge, put the cooler in the fridge but make sure the lid is not sealed on the cooler, so that the air can circulate into the cooler to keep your samples fresh.
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Process samples as soon as possible (sieve, separate, extract DNA, and store)
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Sieve soil samples 2mm sieve before storing
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Weight out soil samples to be stored for long-term storage (~30-50g, depending on your needs) in a sterile manner and store in -80C freezer (make sure bags are properly labeled.
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Weight samples for DNA extraction if extraction will be processed immediately (1-4 days)
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Additional analysis
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Mesure soil moisture (10g in weight boat)
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KCL analysis (Method here), weigh out soils into falcon tube, and process
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Air dry any other soil that will be used for geochem analysis in a sterile hood.
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If not doing any other analysis, soil samples can be sieved, and DNA samples separated (0.25g) into Qiagen tube or extraction kit tube, and the rest of the sieved soil can be stored in the freezer.
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When processing the samples make sure samples remain in a cooler with ice, and clean gloves and utensils with ethanol or bleach between samples to prevent cross-contamination.
Methods & Protocols
Note: protocols listed here have been used in published articles and have been used in the Glassman Lab (Ph.D. Lab). If you have additional questions, please feel free to email me.
Statistical
Analysis
One of the most important aspects of your project
Please see my GitHub account for R script of all statistical analysis used in my publications.
GitHub account here
Contact Information
Microbiology and Plant Pathology
University of California-Riverside
3401 Watkins Driver
Riverside CA 92521
Email: mpuli011@ucr.edu